Go raibh maith agat as cuairt a thabhairt ar Nature.com. Tá leagan brabhsálaí in úsáid agat le tacaíocht theoranta CSS. Chun an taithí is fearr a fháil, molaimid duit brabhsálaí nuashonraithe a úsáid (nó Mód Comhoiriúnachta a dhíchumasú in Internet Explorer). Ina theannta sin, chun tacaíocht leanúnach a chinntiú, taispeánaimid an suíomh gan stíleanna ná JavaScript.
Taispeánann sé carúsal de thrí shleamhnán ag an am céanna. Úsáid na cnaipí Roimhe Seo agus Ar Aghaidh chun bogadh trí thrí shleamhnán ag an am céanna, nó úsáid na cnaipí sleamhnáin ag an deireadh chun bogadh trí thrí shleamhnán ag an am céanna.
Ó ráig an choróinvíris (COVID-19) in 2019, forbraíodh go leor tástálacha tráchtála aimpliúcháin aigéid núicléasaigh (NAATanna) ar fud an domhain agus tá siad anois ina measúnuithe caighdeánacha. Cé gur forbraíodh roinnt tástálacha go tapa agus gur cuireadh i bhfeidhm iad ar thástálacha diagnóiseacha saotharlainne, níor measúnaíodh feidhmíocht na dtástálacha seo i réimse suíomhanna. Dá bhrí sin, bhí sé mar aidhm ag an staidéar seo feidhmíocht mheasúnú a dhéanamh ar mheasúnuithe Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI, agus Sansure Biotech ag baint úsáide as an gCaighdeán Tagartha Ilchodach (CRS). Rinneadh an staidéar ag Institiúid Sláinte Poiblí na hAetóipe (EPHI) ón 1 go dtí an 30 Nollaig 2020. Baineadh 164 sampla nasopharyngeal ag baint úsáide as an trealamh beag QIAamp RNA agus córas ullmhúcháin samplach DNA Abbott. As 164 eiseamal, bhí 59.1% dearfach agus 40.9% diúltach le haghaidh CRS. Bhí dearfacht Sansure Biotech go suntasach íseal i gcomparáid le CRS (p < 0.05). Bhí dearfacht Sansure Biotech go suntasach íseal i gcomparáid le CRS (p < 0.05). Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p < 0,05). Bhí torthaí dearfacha Sansure Biotech i bhfad níos ísle i gcomparáid le CRS (p < 0.05).与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低(p <0.05)。与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低(p <0.05)。 У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). Bhí i bhfad níos lú torthaí dearfacha ag Sansure Biotech i gcomparáid le CRS (p < 0.05).Ba é 96.3–100% comhaontú foriomlán na gceithre anailís i gcomparáid le CRS. Chomh maith leis an ráta dearfach íseal a bhí ag tástáil Sansure Biotech, bhí feidhmíocht na gceithre anailís beagnach inchomparáide. Dá bhrí sin, tá bailíochtú breise ag teastáil le haghaidh úsáide an anailíse Sansure Biotech [Taighde Amháin (RUO)] san Aetóip. Ar deireadh, ba cheart taighde breise a mheas chun anailísí a mheas le héilimh chuí an mhonaróra.
Tá tástáil saotharlainne mar chuid de Phlean Straitéiseach na hEagraíochta Domhanda Sláinte (EDS) maidir le hUllmhacht agus Freagairt (SPRP) i leith Ghalar an Choróinvíris 2019 (COVID-19). Molann an EDS go gcaithfidh tíortha acmhainn saotharlainne a thógáil chun ullmhacht, bainistíocht cheart cásanna, faireachas agus freagairt thapa do dhúshláin sláinte poiblí a fheabhsú. Tugann sé seo le fios go bhfuil ról ríthábhachtach ag an tsaotharlann chun tréithriú an ghalair agus eipidéimeolaíochta gníomhairí tógálacha atá ag teacht chun cinn agus a scaipeadh a rialú.
Éilíonn diagnóis COVID-19 faisnéis eipidéimeolaíoch agus leighis, comharthaí/síomptóim phearsanta, agus sonraí radaighrafaíochta agus saotharlainne2. Ó tuairiscíodh ráig COVID-19 i Wuhan na Síne, tá go leor tástálacha tráchtála aimplithe aigéid núicléasaigh (NAATanna) forbartha ar fud an domhain. Úsáidtear imoibriú slabhrúil polaiméaráise trascríobh droim ar ais fíor-ama (rRT-PCR) mar mhodh gnáthaimh agus caighdeánach chun diagnóis saotharlainne a dhéanamh ar ionfhabhtú siondróm riospráide géarmhíochaine 2 (SARS-CoV-2)3. De ghnáth, bíonn braiteadh móilíneach SARS-CoV-2 bunaithe ar na géinte N (géine próitéine núicléacaipsíde), E (géine próitéine clúdaigh), agus RdRp (géine polaiméaráise RNA atá ag brath ar RNA) i réigiún ORF1a/b (géine fráma léitheoireachta oscailte 1a/b) a shainaithnítear ón ngéanóm víreasach. Meastar gurb iad na príomhréigiúin chaomhnaithe a fhaightear i ngéanóm víreasacha le haghaidh aitheantas víris4. I measc na ngéinte seo, tá íogaireacht ard braite anailíseach ag na géinte RdRp agus E, agus tá íogaireacht anailíseach íseal ag an ngéin N5.
Féadfaidh feidhmíocht measúnuithe PCR a bheith éagsúil ag brath ar fhachtóirí éagsúla amhail: imoibrithe eastósctha, imoibrithe aimpliúcháin/braite, modh eastósctha, cáilíocht an mheaisín PCR agus ionstraimí eile. Ó Aibreán 2020, tá Údarú Úsáide Éigeandála (EUA) faighte ag níos mó ná 48 feiste diagnóiseach éagsúil ó naoi dtír le haghaidh diagnóisic COVID-196. San Aetóip, úsáidtear níos mó ná 14 ardán PCR fíor-ama chun SARS-CoV-2 a bhrath le PCR ag 26 institiúid sláinte poiblí, lena n-áirítear ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 agus Quant-studio7. Ina theannta sin, tá trealamh tástála PCR éagsúla ar fáil, amhail tástáil Daan Gene, tástáil Abbott SARS-CoV-2, tástáil Sansure Biotech, agus tástáil BGI SARS-CoV-2. Cé go bhfuil rRT-PCR an-íogair, tuairiscíonn roinnt othar le COVID-19 torthaí diúltacha bréagacha mar gheall ar chóipeanna neamhleor d'aigéad ribonucleic víreasach (RNA) i samplaí mar gheall ar bhailiú, iompar, stóráil agus láimhseáil mhíchuí, agus tástáil saotharlainne. coinníollacha agus gníomhartha pearsanra8. Ina theannta sin, is féidir le mí-láimhseáil samplaí nó rialaithe, socrú tairseach timthrialla (Ct), agus tras-imoibríocht le haigéid núicléasacha pataigineacha eile nó RNA SARS-CoV-2 neamhghníomhach/iarmharach torthaí dearfacha bréagacha a bheith mar thoradh orthu in aistí rRT-PCR9. Dá bhrí sin, is léir gur féidir le tástálacha PCR iompróirí blúirí géine a aithint i ndáiríre, toisc nach féidir leo fiú idirdhealú a dhéanamh idir géinte víreasacha atá fíorghníomhach, mar sin ní féidir leis na tástálacha ach iompróirí a aithint agus ní othair10. Dá bhrí sin, tá sé tábhachtach feidhmíocht dhiagnóiseach a mheas ag baint úsáide as modhanna caighdeánacha inár suíomh. Cé go bhfuil go leor imoibrithe NAAT ar fáil ag Institiúid Sláinte Poiblí na hAetóipe (EPHI) agus ar fud na tíre, níor tuairiscíodh aon mheastóireacht chomparáideach ar a n-éifeachtúlacht go fóill. Dá bhrí sin, bhí sé mar aidhm ag an staidéar seo feidhmíocht chomparáideach na dtrealamh atá ar fáil go tráchtála a mheas chun SARS-CoV-2 a bhrath trí rRT-PCR ag baint úsáide as eiseamail chliniciúla.
Áiríodh sa staidéar seo 164 rannpháirtí san iomlán a raibh amhras ann go raibh COVID-19 orthu. Tháinig formhór na samplaí ó ionaid chóireála (118/164 = 72%), agus tháinig an 46 rannpháirtí eile (28%) ó ionaid neamhchóireála. I measc na rannpháirtithe nár tugadh cóireáil dóibh san ionad, bhí cásanna a raibh amhras cliniciúil fúthu ag 15 (9.1%) agus bhí teagmháil ag 31 (18.9%) le cásanna deimhnithe. Ba fhir iad nócha trí (56.7%) rannpháirtí, agus ba é 31.10 (± 11.82) bliain meánaois (± SD) na rannpháirtithe.
Sa staidéar seo, cinneadh rátaí dearfacha agus diúltacha ceithre thástáil le haghaidh COVID-19. Dá bhrí sin, ba iad 59.1%, 58.5%, 57.9% agus 55.5% faoi seach na rátaí dearfacha a bhain le measúnacht Abbott SARS-CoV-2, measúnacht Daan Gene 2019-nCoV, measúnacht SARS-CoV-2 BGI, agus measúnacht Sansure Biotech 2019-nCoV. Ba iad 97 (59.1%) agus 67 (40.9%), faoi seach, na scóir chaighdeáin tagartha ilchodacha (CRS) dearfacha agus diúltacha (Tábla 1). Sa staidéar seo, bhí sainmhíniú CRS bunaithe ar an riail "aon toradh dearfach", áit a measadh as ceithre thoradh tástála, gur fíor-dhearfach nó fíor-dhiúltach dhá thoradh tástála nó níos mó a thug an toradh céanna.
Sa staidéar seo, fuarthas comhaontú céatadáin dhiúltach (NPA) de 100% (95% CI 94.6–100) do na hanailísí uile i gcomparáid le CRS. Léirigh anailís Sansure Biotechnology PPA íosta de 93.8% (95% CI 87.2-97.1) agus bhí comhaontú foriomlán de 99.4% (95% CI 96.6-99.9) ag anailís Daan Gene 2019-nCoV. I gcodarsnacht leis sin, ba é 98.8% agus 96.3% an comhaontú foriomlán idir an tástáil SARS-CoV-2 BGI agus an tástáil Sansure Biotech 2019-nCoV, faoi seach (Tábla 2).
Bhí comhéifeacht comhaontaithe kappa Cohen idir torthaí tástála CRS agus Abbott SARS-CoV-2 go hiomlán comhsheasmhach (K = 1.00). Ar an gcaoi chéanna, tá luachanna kappa Cohen a braitheadh le Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, agus Sansure Biotech 2019-nCoV go hiomlán comhsheasmhach le CRS freisin (K ≥ 0.925). Sa anailís chomparáideach seo, léirigh an tástáil chi-chearnógach (tástáil McNemar) go raibh torthaí tástála Sansure Biotech 2019-nCoV difriúil go suntasach ó thorthaí CRS (p = 0.031) (Tábla 2).
Mar a thaispeántar i bhFíor.1 ba é 87.6% céatadán an luacha Ct is ísle (< 20 Ct) de mheasúnacht Abbott SARS-CoV-2 (géin RdRp agus N comhcheangailte) agus léirigh luach Ct an ghéin ORF1a/b de mheasúnacht Sansure Biotech 2019-nCoV gurbh é 50.3% céatadán an luacha Ct íseal (< 20 Ct) agus gurbh é 3.2% an luach Ct ard (36–40 Ct). 1 ba é 87.6% céatadán an luacha Ct is ísle (< 20 Ct) de mheasúnacht Abbott SARS-CoV-2 (géin RdRp agus N comhcheangailte) agus léirigh luach Ct an ghéin ORF1a/b de mheasúnacht Sansure Biotech 2019-nCoV gurbh é 50.3% céatadán an luacha Ct íseal (< 20 Ct) agus gurbh é 3.2% an luach Ct ard (36–40 Ct).Mar a thaispeántar i bhFíor.1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) анализа Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp agus N) состачения Ct (< 20 Ct) анализа Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp agus N) состаченил, 87, зил ORF1a/b анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял 50,3%, ацент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял 50,3%, аы соне (36–40 Ct) составляло 3,2 %. 1, ba é 87.6% céatadán anailíse an luacha Ct is ísle (< 20 Ct) ar Abbott SARS-CoV-2 (géin chomhcheangailte RdRp agus N), agus léirigh anailís luach Ct géine ORF1a/b ar Sansure Biotech 2019-nCoV gur bhain 50.3% leis an gcéatadán de luach Ct íseal (< 20 Ct), agus gur bhain 3.2% leis an luach Ct ard (36–40 Ct).如图1所示,Abbott SARS-CoV-2 检测(结合RdRp 和N 基因)的最低Ct 值百分比(< 20 Ct.7) 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(<20 Ct) 的百分比为50.3%,高Ct 值(36)-0 Ct 值(36) níos mó ná 3.2%. Mar a thaispeántar i bhFíor 1, is é 87.6% an céatadán luacha Ct is ísle (< 20 Ct) de thástáil Abbott SARS-CoV-2 (meascán de ghéin RdRp agus N), taispeánann luach Ct an ghéin ORF1a/b de thástáil Sansure Biotech 2019-nCoV céatadán íseal Ct (< 20 Ct) ná 50.3%, agus is é 3.2% an céatadán íseal Ct (36–40 Ct). Как показано на рисунке 1, анализ Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp agus N) имел самое низкое проце Ct) в размере 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b san исследовании Sansure Biotech 2019- Анализ nCoV показал низкий Ct. Mar a thaispeántar i bhFíor 1, bhí an luach céatadáin Ct is ísle (< 20 Ct) ag measúnacht Abbott SARS-CoV-2 (ag comhcheangal na ngéinte RdRp agus N) ag 87.6%, agus bhí luach Ct an ghéin ORF1a/b i staidéar Sansure Biotech 2019 – Léirigh anailís nCoV Ct íseal. Процент значений (< 20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) составил 3,2%. Ba é 50.3% céatadán na luachanna (< 20 Ct), agus ba é 3.2% céatadán na luachanna Ct arda (36–40 Ct).Thaifead tástáil Abbott SARS-CoV-2 B luachanna Ct os cionn 30. Ar an láimh eile, ar thástáil BGI SARS-CoV-2, bhí luach Ct ard (> 36 Ct) ag an ngéin ORF1a/b agus ba é 4% an céatadán (Fíor 1). Ar an láimh eile, ar thástáil BGI SARS-CoV-2, bhí luach Ct ard (> 36 Ct) ag an ngéin ORF1a/b agus ba é 4% an céatadán (Fíor 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которогол сон 4 (% 4). Ar an láimh eile, in anailís ar ghéin SARS-CoV-2 BGI, bhí luach Ct ard (> 36 Ct) ag ORF1a/b, agus ba é 4% an céatadán de sin (Fíor 1).另一方面,在BGI SARS-CoV-2 检测中,ORF1a/b 基因具有高Ct 值(> 36 Ct)的百分比为4%( Ar an láimh eile, i mbrath BGI SARS-CoV-2, is é 4% céatadán an ghéin ORF1a/b a bhfuil luach Ct ard aige (>36 Ct) (Fíor 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 процент генов ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (4%). Ar an láimh eile, san anailís BGI SARS-CoV-2, ba é 4% céatadán na ngéinte ORF1a/b a raibh luachanna arda Ct acu (>36 Ct) (Fíor 1).
Sa staidéar seo, ghlacamar 164 sampla nasopharyngeal. I gcás gach cineál tástála, rinneadh aonrú agus aimpliú RNA ag baint úsáide as na modhanna agus na trealamh a mhol na monaróirí faoi seach.
Léirigh an staidéar seo go bhfuil an fheidhmíocht bhrath chéanna ag tástáil Abbott do SARS-CoV-2 agus atá ag CRS, le comhréireacht 100% dearfach, diúltach agus foriomlán. Is é 1.00 comhaontú kappa Cohen, rud a léiríonn comhaontú iomlán le CRS. Fuair staidéar comhchosúil ó Ollscoil Washington sna Stáit Aontaithe go raibh íogaireacht agus sainiúlacht fhoriomlán thástáil Abbott do SARS-CoV-2 93% agus 100%, faoi seach, i gcomparáid leis an measúnacht saotharlainne-chinnte (LDA) de chuid na Lárionada um Rialú agus Cosc Galar (CDC). 11. Tá córas braite Abbott SARS-CoV-2 bunaithe ar bhrath comhuaineach comhcheangailte na ngéinte N agus RdRp, toisc go bhfuil an dá ghéin níos íogaire, rud a íoslaghdaíonn diúltacha bréagacha12. Léirigh staidéar i Vín na hOstaire freisin gur íoslaghdaigh toirteanna móra samplaí eastósctha agus toirteanna móra eisilteora braite éifeachtaí caolaithe agus gur mhéadaigh siad éifeachtúlacht bhrath13. Dá bhrí sin, is féidir meaitseáil fhoirfe Abbott don mheasúnacht SARS-CoV-2 a cheangal le córas braite ardáin a bhraith géinte comhcheangailteacha ag an am céanna, a bhaintear líon mór samplaí (0.5 ml), agus a úsáideann méid mór eluent (40 µl).
Léirigh ár dtorthaí freisin go raibh feidhmíocht bhrath na tástála géiniteacha Daan beagnach mar a chéile le feidhmíocht bhrath CRS. Tá sé seo ag teacht le staidéar14 a rinneadh in Ollscoil Anhui i Huainan, an tSín, agus éileamh an mhonaróra go raibh comhaontú 100% dearfach ann. In ainneoin tuairiscí ar thorthaí comhsheasmhacha, bhí sampla amháin bréag-dhiúltach tar éis an t-eluate céanna a aththástáil, ach bhí sé dearfach i measúnuithe Abbott SARS-CoV-2 agus Sansure Biotech nCoV-2019. Tugann sé seo le fios go bhféadfadh éagsúlacht a bheith sna torthaí trasna cineálacha éagsúla measúnuithe. Mar sin féin, sa staidéar a rinneadh sa tSín15, bhí toradh an mheasúnachta Daan Gene difriúil go suntasach (p < 0.05) i gcomparáid lena measúnacht tagartha a shainmhínigh an saotharlann. Mar sin féin, sa staidéar a rinneadh sa tSín15, bhí toradh an mheasúnachta Daan Gene difriúil go suntasach (p < 0.05) i gcomparáid lena measúnacht tagartha a shainmhínigh an saotharlann. Тем не менее, в исследовании, проведенном in Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (5)
(0) labatornogo etalonnogo analizza. Mar sin féin, i staidéar sa tSín15, bhí toradh anailíse Daan Gene difriúil go suntasach (p < 0.05) óna n-anailís tagartha saotharlainne.然而,在中国进行的研究中15,大安基因检测的cliceáil grianghraif níos mó a fheiceáil < 0.05).然而,在中国进行的研究中15,大安基因检测cliceáil grianghraif níos mó a fheiceáil <0.05 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отлсиь < 5 , 0 сравнению с ego еталонным labораторным тестом. Mar sin féin, i staidéar sa tSín15, bhí torthaí thástáil ghéiniteach Daan difriúil go suntasach (p < 0.05) i gcomparáid lena thástáil saotharlainne tagartha.D’fhéadfadh an neamhréireacht seo a bheith mar gheall ar íogaireacht an tástála tagartha chun SARS-CoV-2 a bhrath, agus d’fhéadfadh go mbeadh tábhacht le tuilleadh staidéar chun an chúis a chinneadh.
Ina theannta sin, rinne ár staidéar meastóireacht ar fheidhmíocht chomparáideach an tástála SARS-CoV-2 BGI le CRS, ag léiriú comhaontú céatadáin dhearfach den scoth (PPA = 97.9%), comhaontú céatadáin dhiúltach (NPA = 100%), agus comhaontú céatadáin foriomlán de réir inscne (OPA). = 98.8%). Léirigh luachanna Kappa Cohen comhaontú maith (K = 0.975). Léirigh staidéir san Ísiltír16 agus sa tSín15 torthaí comhsheasmhacha. Is tástáil braite géine aonair (ORF1a/b) í an tástáil SARS-CoV-2 BGI ag baint úsáide as 10 µl d'eluate aimpliúcháin/braite. In ainneoin comhaontú staitistiúil maith lenár dtorthaí tagartha, chaill an anailís dhá shampla dhearfacha (1.22%) den sampla iomlán. Is féidir impleachtaí cliniciúla ollmhóra a bheith aige seo maidir le dinimic tarchuir ag leibhéal an othair agus an phobail araon.
Anailís chomparáideach eile a áiríodh sa staidéar seo ná an anailís Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO); ba é 96.3% an céatadán meaitseála foriomlán. Cinneadh neart an chomhaontaithe freisin le luach Kappa Cohen, a bhí 0.925, rud a léiríonn comhaontú iomlán leis an CRS. Arís, tá ár dtorthaí comhionann le staidéir a rinneadh in Ollscoil Lár Theas i Changsha, an tSín, agus i Roinn Saotharlainne Cliniciúla Ospidéal Phobail Liuzhou, Cathair Liuzhou, an tSín17. Cé gur taifeadadh an chomhréireacht mhaith staitistiúil thuas, léirigh an tástáil chi-chearnógach (tástáil MacNemar) go raibh difríocht shuntasach ó thaobh staitisticí de i dtáirge thástáil Sansure Biotech i gcomparáid le CRS (p < 0.005). Cé gur taifeadadh an chomhréireacht mhaith staitistiúil thuas, léirigh an tástáil chi-chearnógach (tástáil MacNemar) go raibh difríocht shuntasach ó thaobh staitisticí de i dtáirge thástáil Sansure Biotech i gcomparáid le CRS (p < 0.005). Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, крвитишие (критерий Макнемара) показал, что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое разлиочи 0,005). Cé gur taifeadadh an comhaontú staitistiúil maith thuas, léirigh an tástáil chi-chearnógach (tástáil McNemar) go raibh difríocht shuntasach ó thaobh staitisticí de i dtáirge an anailíse Sansure Biotech i gcomparáid leis an CRS (p < 0.005).尽管记录了上述良好的统计一致性,Dúirt MacNemar, Sansure Biotech, Sansure Biotech 暣瓋絋甀相比具有统计学显着差异(p <0.005).尽管计记录了上述良好统计一致性, 但 检验 (macnemar 检验表明), sansure biotech 测 怎 , sansure biteicneolaíochta相比具有显着((p <0.005。。。。。。。。。。。。。。。〉))) Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерипаМаМема статистически значимую разницу (p < 0,005) между анализом Sansure Biotech agus CRS. In ainneoin an chomhaontaithe staitistiúil mhaith a luadh thuas, léirigh an tástáil chi-chearnógach (tástáil McNemar) difríocht shuntasach ó thaobh staitisticí de (p < 0.005) idir an tástáil Sansure Biotech agus an CRS.Fuarthas amach go raibh sé shampla (3.66%) bréag-dhiúltacha i gcomparáid le CRS (Tábla Forlíontach 1); tá sé seo an-tábhachtach, go háirithe i bhfianaise dhinimic tharchur an víris. Tacaíonn na sonraí thuas leis an ráta braite íseal seo freisin15.
Sa staidéar seo, cinneadh luachanna Ct do gach measúnacht agus ardán faoi seach, agus an meánluach Ct is ísle tuairiscithe i measúnacht Abbott SARS-CoV-2. D’fhéadfadh an toradh seo a bheith bainteach le córas tástála géiniteach comhcheangailte comhuaineach Abbott chun SARS-CoV-2 a bhrath. Dá bhrí sin, de réir Fíor 1, bhí luachanna Ct faoi bhun 20 ag 87.6% de thorthaí Abbott SARS-CoV-2. Ní raibh ach líon beag torthaí samplach (12.4%) sa raon 20-30. Níor taifeadadh luachanna Ct os cionn 30. Chomh maith le húsáid Abbott den fhormáid tástála géiniteach painéil SARS-CoV-2, d’fhéadfadh an toradh seo a bheith bainteach leis an teorainn bhrath níos ísle (32.5 cóip RNA/mL)18, atá trí huaire níos ísle ná teorainn níos ísle na cuideachta de 100 cóip RNA/mL. ml)19.
Tá roinnt teorainneacha leis an staidéar seo: ar an gcéad dul síos, níl modhanna caighdeánacha/tagartha againn [amhail ualach víreasach nó tástálacha saotharlainne eile (LDA)] mar gheall ar easpa acmhainní. Ar an dara dul síos, ba swabanna nasopharyngeal iad na heiseamail uile a úsáideadh sa staidéar seo, agus ní raibh na torthaí infheidhme maidir le cineálacha eile eiseamail, agus ar an tríú dul síos, bhí méid ár sampla beag.
Rinne an staidéar seo comparáid idir feidhmíocht ceithre mheasúnú rRT-PCR le haghaidh SARS-CoV-2 ag baint úsáide as samplaí nasopharyngeal. Bhí feidhmíocht beagnach inchomparáide ag na measúnuithe braite uile, seachas measúnú Sansure Biotech. Thairis sin, aithníodh an ráta dearfachta íseal sa mheasúnacht Sansure Biotech i gcomparáid leis an CRS (p < 0.05). Thairis sin, aithníodh an ráta dearfachta íseal sa mheasúnacht Sansure Biotech i gcomparáid leis an CRS (p < 0.05). Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению < с CRS, 5. Ina theannta sin, léirigh tástáil Sansure Biotech céatadán íseal torthaí dearfacha i gcomparáid le CRS (p < 0.05).此外, 与 CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低(lch < 0.05).此外, 与 CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低(lch < 0.05). Кроме того, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению < с CRS,5. Ina theannta sin, bhí ráta dearfachta níos ísle ag measúnacht Sansure Biotech i gcomparáid le CRS (p < 0.05).Sháraigh anailís Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) ar PPA, NPA agus comhaontú foriomlán 93.5% le luach neart comhaontaithe Cohen Kappa de 0.925. Ar deireadh, ní mór bailíochtú breise a dhéanamh ar Thástáil Sansure Biotech (RUO) lena húsáid san Aetóip, agus ba cheart taighde breise a mheas chun éilimh ó mhonaróirí aonair a mheas.
Rinneadh dearadh staidéir chomparáideach ag ceithre shaoráid sláinte in Addis Ababa, Ospidéal Eka Kotebe, Ionad Cóireála Eaglais na Mílaoise, Ospidéal Cuimhneacháin Zewooditu, agus Ospidéal Speisialtóireachta Eitinn Naomh Peadar. Bailíodh na sonraí idir 1 agus 31 Nollaig, 2020. Roghnaíodh na saoráidí leighis don staidéar seo d'aon ghnó bunaithe ar a líon ard cásanna agus infhaighteacht na bpríomhionad cóireála sa chathair. Ar an gcaoi chéanna, roghnaíodh ionstraimí, lena n-áirítear ionstraimí PCR fíor-ama ABI 7500 agus Abbott m2000, de réir mholtaí mhonaróirí imoibrithe NAAT, agus roghnaíodh ceithre threalamh braite PCR don staidéar seo, toisc gur úsáid formhór na saotharlann san Aetóip ceithre cinn acu ar a laghad. Rinneadh tástáil géine, tástáil Abbott SARS-CoV-2, tástáil Sansure Biotech, agus tástáil BGI SARS-CoV-2 le linn an staidéir.
Rinneadh tástáil le haghaidh SARS-CoV-2 ón 1 go dtí an 30 Nollaig 2020 ag baint úsáide as 3 ml de Mheán Iompair Víreasach (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, an tSín) ó dhaoine aonair a bhí faoi imscrúdú le haghaidh COVID-19 a atreoraíodh chuig EPHI. Bailíodh samplaí nasopharyngeal ag bailitheoirí sampla oilte agus seoladh chuig EPHI iad i bpacáistí trífhillte. Sula ndéantar aigéad núicléasach a leithlisiú, sanntar uimhir aitheantais uathúil do gach sampla. Déantar eastóscadh ó gach sampla díreach tar éis dó teacht ag baint úsáide as modhanna eastósctha láimhe agus uathoibríocha. Dá bhrí sin, chun Abbott m2000 a eastóscadh go huathoibríoch, eastóscadh 1.3 ml (lena n-áirítear 0.8 ml toirt marbh agus 0.5 ml toirt ionraoin eastósctha) den sampla ó gach sampla agus cuireadh tríd an gCóras Ullmhúcháin Sampla DNA Abbott (Abbott Molecular Inc. des Plaines, IL, SAM) é. ) Cuireadh baisc de 96 [92 shampla, dhá rialú braite agus dhá rialú neamh-theimpléid (NTC)] san áireamh sa phróiseas foriomlán (aisghabháil agus braite) de dhá bhabhta de SARS-CoV-2 (EUA) i bhfíor-am. mianadóireacht. Ar an gcaoi chéanna, le haghaidh eastóscadh láimhe, bain úsáid as na samplaí céanna (le haghaidh eastóscadh agus fionnachtana uathoibríoch). Dá bhrí sin, i rith an phróisis, rinneadh 140 µl de shamplaí a aliquoted agus a eastóscadh ag baint úsáide as an QIAamp Viral RNA Mini Kit (QIAGEN GmbH, Hilden, an Ghearmáin) i mbaisceanna de 24 (lena n-áirítear 20 sampla, dhá rialú measúnachta agus dhá NTC) thar naoi mbabhta. Rinneadh na heluates a eastóscadh de láimh a aimpliú agus a bhrath ag baint úsáide as timthriallóir teirmeach ABI 7500 ag baint úsáide as measúnacht SARS-CoV-2 BGI, measúnacht Daan Gene, agus measúnacht Sansure Biotech.
Leanann aonrú agus íonú uathoibrithe RNA víreasach SARS-CoV-2 prionsabal na gcoirníní maighnéadacha ag baint úsáide as imoibrithe ullmhúcháin sampla DNA Abbott. Déantar díghníomhachtú samplaí agus intuaslagthacht na gcáithníní víreasacha ag baint úsáide as glantach ina bhfuil iseitiacianáit guanidine chun an próitéin a dhínádúrú agus RNase a dhíghníomhachtú. Ansin, déantar an RNA a dheighilt ón bpróitéin trí dheighilt céime soladaí ag baint úsáide as shilice, i.e. cuireann an salann guanidinium agus pH alcaileach an mhaoláin líse ceangal na n-aigéad núicléasach leis an shilice (SiO2) chun cinn. Baintear próitéiní agus smionagar atá fágtha sa chéim sruthlaithe chun tuaslagán soiléir a tháirgeadh. Déantar RNA trédhearcach a aonrú ó mhicreacáithníní bunaithe ar shilice ag baint úsáide as réimse maighnéadach an ionstraime20,21. Ar an láimh eile, déantar aonrú agus íonú láimhe ar RNA tríd an modh colún sníomha ag baint úsáide as lártheifneoiriú in ionad seastáin mhaighnéadaigh agus deighilt na micreacáithníní ón eluent.
Rinneadh Tástáil Braite Abbott Real-Time SARS-CoV-2 (Abbott Molecular, Inc.) de réir threoracha an mhonaróra, a fuair EUA19,22 ón WHO agus ón FDA. Sa phrótacal seo, rinneadh díghníomhachtú samplach roimh an eastóscadh i ndabhach uisce ag 56 °C ar feadh 30 nóiméad. Tar éis díghníomhachtú an víris, rinneadh eastóscadh aigéid núicléasaigh ar ionstraim Abbott m2000 SP ó 0.5 ml VTM ag baint úsáide as córas ullmhúcháin samplach DNA Abbott m2000, de réir an mhonaróra. Rinneadh aimpliú agus brath ag baint úsáide as ionstraim Abbott m2000 RT-PCR, agus rinneadh brath dúbailte ar na géinte RdRp agus N. ROX) agus VIC P (lí dílseánaigh) chun rialuithe inmheánacha a spriocdhíriú agus a bhrath, rud a cheadaigh brath comhuaineach ar an dá tháirge aimpliúcháin 19.
Tá an modh braite aimpliúcháin atá sa trealamh seo bunaithe ar theicneolaíocht RT-PCR aonchéime. Roghnaíodh na géinte ORF1a/b agus N mar réigiúin chaomhnaithe ag Daan Gene Technology chun aimpliú réigiúin sprice a bhrath. Dearadh tosaitheoirí sonracha agus tóireadóirí fluaraiseacha (tóireadóirí géine N lipéadaithe le FAM, tóireadóirí ORF1a/b lipéadaithe le VIC) chun RNA SARS-CoV-2 a bhrath i samplaí. Ullmhaíodh an t-eluent deiridh agus na meascáin mháistir trí 5 µl d'eluent a chur le 20 µl den mheascán máistir go dtí toirt deiridh de 25 µl. Rinneadh aimpliú agus brath ag an am céanna ar ionstraim PCR fíor-ama ABI 750024.
Braitheadh na géinte ORF1a/b agus N ag baint úsáide as an Tacar Diagnóiseach Aigéid Núicléasaigh Sansure Biotech nCoV-2019 (brath PCR fluaraiseach). Ullmhaigh tóireadóirí sonracha do gach géin sprice tríd an gcainéal FAM a roghnú don réigiún ORF1a/b agus an cainéal ROX don ghéin N. Cuirtear imoibrithe eluent agus meascáin mháistir leis an tacar tástála seo mar seo a leanas: ullmhaigh 30 µl d'imoibrí meascáin mháistir agus 20 µl d'shampla eluáilte le haghaidh braite/aimplithe. Baineadh úsáid as PCR fíor-ama ABI 750025 le haghaidh aimplithe/braite.
Is trealamh rRT-PCR fíor-ama fluaraiseach é tástáil SARS-CoV-2 BGI chun COVID-19 a dhiagnóisiú. Tá an réigiún sprice suite i réigiún ORF1a/b de ghéanóm SARS-CoV-2, ar modh braite géine aonair é. Ina theannta sin, is géin sprice rialaithe go hinmheánach é an géin tí daonna β-actin. Ullmhaítear an máistir-mheascán trí 20 µl den imoibrí máistir-mheascáin agus 10 µl den sampla RNA eastósctha a mheascadh i bpláta tobair26. Baineadh úsáid as ionstraim chainníochtúil PCR fíor-ama fluaraiseach ABI 7500 le haghaidh aimpliú agus braite. Rinneadh gach aimpliú aigéad núicléasach, coinníollacha rith PCR do gach measúnacht, agus léirmhíniú na dtorthaí de réir threoracha an mhonaróra faoi seach (Tábla 3).
Sa anailís chomparáideach seo, níor úsáideadh an modh caighdeánach tagartha chun céatadán an chomhaontaithe (dearfach, diúltach, agus foriomlán) agus paraiméadair chomparáide eile a chinneadh do na ceithre anailís. Rinneadh gach comparáid tástála le CRS, sa staidéar seo socraíodh an CRS leis an riail "aon dearfach" agus cinneadh an toradh, ní le tástáil aonair, úsáideadh dhá thoradh tástála meaitseáilte ar a laghad. Ina theannta sin, i gcás tarchur COVID-19, tá torthaí diúltacha bréagacha níos contúirtí ná torthaí dearfacha bréagacha. Dá bhrí sin, chun "dearfach" a rá chomh cruinn agus is féidir ó thoradh CRS, ní mór dhá thástáil measúnachta ar a laghad a bheith dearfach, rud a chiallaíonn go bhfuil seans maith ann go dtiocfaidh toradh dearfach amháin ar a laghad ó mheasúnacht EUA. Dá bhrí sin, as ceithre thoradh tástála, meastar go bhfuil dhá thoradh tástála nó níos mó a thugann an toradh céanna fíor-dhearfach nó diúltach18,27.
Bailíodh sonraí ag baint úsáide as foirmeacha struchtúrtha eastósctha sonraí, rinneadh iontráil sonraí agus anailísiú ag baint úsáide as bogearraí staitistiúla Excel agus SPSS leagan 23.0 le haghaidh staitisticí tuairisciúla. Rinneadh anailís ar chomhaontú dearfach, diúltach agus céatadán foriomlán, agus úsáideadh scór Kappa chun céim chomhaontaithe gach modha le CRS a chinneadh. Léirmhínítear luachanna Kappa mar seo a leanas: 0.01 go 0.20 le haghaidh comhaontú éadrom, 0.21 go 0.40 le haghaidh comhaontú ginearálta, 0.41-0.60 le haghaidh comhaontú measartha, 0.61-0.80 le haghaidh comhaontú mór agus 0.81-0.99 le haghaidh comhaontú iomlán28.
Fuarthas imréiteach eiticiúil ó Ollscoil Addis Ababa agus cheadaigh Bord Athbhreithnithe Eitice Eolaíochta Institiúid Sláinte Poiblí na hAetóipe na prótacail turgnamhacha uile don staidéar seo. Is é EPHI/IRB-279-2020 uimhir thagartha Cheadúnas Eitice EPHI. Cuireadh na modhanna uile i bhfeidhm i gcomhréir le moltaí agus forálacha Threoirlínte Cuimsitheacha Náisiúnta na hAetóipe maidir le Cóireáil COVID-19. Ina theannta sin, fuarthas toiliú feasach i scríbhinn ó gach rannpháirtí staidéir roimh rannpháirtíocht sa staidéar.
Tá na sonraí uile a fuarthas nó a ndearnadh anailís orthu sa staidéar seo san áireamh san alt foilsithe seo. Tá sonraí a thacaíonn le torthaí an staidéir seo ar fáil ón údar faoi seach ar iarratas réasúnta.
An Eagraíocht Dhomhanda Sláinte. Moltaí maidir le Straitéisí Tástála Saotharlainne le haghaidh COVID-19: Treoir Eatramhach, 21 Márta, 2020 Uimh. WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (EDS, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI Diagnóis chliste COVID-19 sa Roinn Éigeandála: Gach rud i gcleachtas. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI Diagnóis chliste COVID-19 sa Roinn Éigeandála: Gach rud i gcleachtas.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. agus Gurgulianis, KI Diagnóis chliste ar COVID-19 sa roinn éigeandála: gach rud i gcleachtas.Muliou DS, Pantazopoulos I. agus Gurgulyanis KI Diagnóis chliste ar COVID-19 i ranna éigeandála: comhtháthú ó thús deireadh sa chleachtas. Expert Reverend Respire. medicine. 3, 263–272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. Measúnú ar thástáil COVID19 ID NOW EUA. Mitchell, SL & St George, K. Measúnú ar thástáil COVID19 ID NOW EUA.Mitchell, SL agus St. George, K. Measúnú ar thástáil COVID19 ID NOW EUA.Mitchell SL agus St. George K. Measúnú ar thástáil COVID19 ID NOW EUA. J. Clinical. Virus. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
An Eagraíocht Dhomhanda Sláinte. Brath saotharlainne ar ghalar an choróinvíris 2019 (COVID-19) i ndaoine a bhfuil amhras fúthu go bhfuil galar orthu. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (rochtain déanta 15 Lúnasa 2020) (An Eagraíocht Dhomhanda Sláinte, 2020).
Udugama, B. et al. Diagnóis COVID-19: Galair agus Uirlisí Tástála. ACS Nano 14(4), 3822–3835 (2020).
Syed S. et al. Bunú Choláiste Paiteolaithe Oirthear, Láir agus Theas na hAfraice – Scoil Réigiúnach Paiteolaíochta an Mheánoirthir agus na hAfraice Theas. An Afraic. J. Lab. medicine. 9(1), 1-8 (2020).
Institiúid Sláinte Poiblí na hAetóipe, Aireacht Sláinte Chónaidhme. Straitéis Náisiúnta agus Treoir Eatramhach maidir le Diagnóis Saotharlainne COVID-19. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (rochtain déanta 12 Lúnasa 2020) (EPHI, 2020).
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Tástálacha diúltacha bréagacha le haghaidh dúshláin agus impleachtaí ionfhabhtaithe SARS-CoV-2. Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Tástálacha diúltacha bréagacha le haghaidh dúshláin agus impleachtaí ionfhabhtaithe SARS-CoV-2.Voloshin S., Patel N. agus Kesselheim AS Tástálacha bréag-dhiúltacha le haghaidh ionfhabhtuithe SARS-CoV-2 agus a n-iarmhairtí.Voloshin S., Patel N. agus Kesselheim AS Tástálacha bréag-dhiúltacha le haghaidh spreagadh agus tionchar ionfhabhtaithe SARS-CoV-2. N. eng. J. Medicine. 383(6), e38 (2020).
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Cásanna COVID-19 bréag-dhearfacha agus bréag-dhiúltacha: Straitéisí coisctheacha agus bainistíochta riospráide, vacsaíniú, agus tuilleadh peirspictíochtaí. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Cásanna COVID-19 bréag-dhearfacha agus bréag-dhiúltacha: Straitéisí coisctheacha agus bainistíochta riospráide, vacsaíniú, agus tuilleadh peirspictíochtaí. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Ложноположительные agus ложноотрицательные случаи COVID-19: респираторная профикила лечения, вакцинация и дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Cásanna dearfacha bréagacha agus diúltacha bréagacha de COVID-19: straitéisí coisctheacha agus cóireála riospráide, vacsaíniú agus an bealach chun cinn.Muliu, DS agus Gurgulianis, KI Cásanna bréag-dhearfacha agus bréag-dhiúltacha de COVID-19: straitéisí chun cosc agus cóireáil riospráide a chosc, vacsaíniú agus an bealach chun cinn. An tUrramach Saineolaí Respire. leigheas. 15(8), 993–1002 (2021).
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Diagnóis COVID-19 sa roinn éigeandála: An crann a fheiceáil ach an fhoraois a chailleadh. Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Diagnóis COVID-19 sa roinn éigeandála: An crann a fheiceáil ach an fhoraois a chailleadh.Mouliou, DS, Ioannis, P. agus Konstantinos, G. Diagnóis COVID-19 sa Roinn Éigeandála: Féach an Crann, Caill an Fhoraois.Muliou DS, Ioannis P., agus Konstantinos G. Diagnóis COVID-19 i Seomraí Éigeandála: Gan Go Leor Foraoise do na Crainn. Appear. medicine. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-Angeli, E. et al. Bailíochtú agus Bailíochtú ar Fheidhmíocht Anailíseach agus Cliniciúil Mheasúnacht Abbott RealTime SARS-CoV-2. J. Clinical. Virus. 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Comparáid idir cúig shraith tosaitheoirí ó réigiúin ghéanóim éagsúla de COVID-19 chun ionfhabhtú víris a bhrath trí RT-PCR traidisiúnta. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Comparáid idir cúig shraith tosaitheoirí ó réigiúin ghéanóim éagsúla de COVID-19 chun ionfhabhtú víris a bhrath trí RT-PCR traidisiúnta.Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. agus Aflatunyan, B. Comparáid idir cúig shraith tosaitheoirí ó réigiúin éagsúla de ghéanóm COVID-19 chun ionfhabhtú víreasach a bhrath trí RT-PCR traidisiúnta. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组,用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染。 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Comparáid idir 5 réigiún géiniteacha éagsúla de COVID-19 chun ionfhabhtú víreasach a bhrath trí RT-PCR traidisiúnta.Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. agus Aflatunyan B. Comparáid idir cúig shraith tosaitheoirí ó réigiúin éagsúla de ghéanóm COVID-19 chun ionfhabhtú víreasach a bhrath trí RT-PCR traidisiúnta.An Iaráin. J. Micribhitheolaíocht. 12(3), 185 (2020).
Goertzer, I. et al. Réamhthorthaí an chláir mheasúnaithe cáilíochta seachtrach náisiúnta chun seichimh ghéanóim SARS-CoV-2 a bhrath. J. Clinical. Virus. 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
Wang, M. et al. Measúnú Anailíseach ar Éifeachtúlacht Cúig Threalamh RT-PCR le haghaidh Siondróm Géarmhíochaine Riospráide Tromchúiseach Coróinvíris 2. J. Clinical. saotharlann. anus. 35(1), e23643 (2021).
Wang B. et al. Measúnú ar sheacht dtrealamh braite RNA SARS-CoV-2 atá ar fáil go tráchtála sa tSín bunaithe ar imoibriú slabhrúil polaiméaráise (PCR) fíor-ama. cliniciúil. ceimiceach. saotharlann. leigheas. 58(9), e149–e153 (2020).
van Casteren, PB et al. Comparáid idir seacht dtrealamh diagnóiseach tráchtála RT-PCR COVID-19. J. Clinical. Virus. 128, 104412 (2020).
Lu, Yu, et al. Comparáid idir feidhmíocht dhiagnóiseach dhá threalamh PCR chun aigéid núicléacha SARS-CoV-2 a bhrath. J. Clinical. saotharlann. anus. 34(10), e23554 (2020).
Lefart, PR, etc. Léirigh staidéar comparáideach ar cheithre ardán tástála aimpliúcháin aigéid núicléasaigh (NAAT) SARS-CoV-2 go raibh feidhmíocht ID NOW lagaithe go suntasach ag brath ar an othar agus ar an gcineál sampla. diagnóis. micribhitheolaíocht. Infect. diss. 99(1), 115200 (2021).
Móilín Abbott. Bileog faisnéise don phacáiste anailíse fíor-ama SARS-CoV-2 Abbott. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (Ón 10 Lúnasa, 2020) (2020).
Klein, S. et al. Aonrú RNA SARS-CoV-2 ag baint úsáide as coirníní maighnéadacha le haghaidh braite tapa ar scála mór le RT-qPCR agus RT-LAMP. Víreas 12(8), 863 (2020).
Am an phoist: 08 Nollaig 2022
文网站